Target

All students, faculty, and staff of Science Tokyo who have a TSUBAME account
　You may participate in all workshops listed in the table below.
All TSUBAME account holders
　You may participate in the following workshops listed in the table below:
　　Introduction to TSUBAME (Linux Basics), GPU Programming, Parallel Programming, Gaussian / GaussView

Notes

A TSUBAME account is required to attend any workshop. If you do not yet have an account, please refer to the account registration guide.
Workshops will be conducted primarily in person, with some sessions offered online.
- In-person Workshops
  - Participants may be required to use their own laptop computers during hands-on sessions.
  - If you wish to use the computers in the training room, you must set a password for the training room terminals through the Educational Computer System (On-campus Access Only) in the Science Tokyo Science and Engineering Portal.
  - Participants from the Medical and Dental Sciences fields and external participants will be provided with guest accounts on the day of the workshop and therefore do not need to complete this setup.
- Online Workshops
  - Access information, including the meeting URL, will be sent to participants by email at a later date.
  - Recording, screen recording, and redistribution of online workshops are strictly prohibited. Recordings will not be provided.
Except for Introduction to TSUBAME (Linux Basics), all workshops assume that participants are familiar with basic Linux operations such as file management and command-line usage. Participants who are not comfortable with these fundamentals may have difficulty following the course material, and questions regarding basic Linux operations may disrupt the progress of the workshop. If you are not confident in your Linux skills, we strongly recommend attending Introduction to TSUBAME (Linux Basics) before taking other workshops.
If you become unable to attend after registering, please notify us through the workshop application form. Participants who cancel without notice may be restricted from attending future workshops.

How to Apply

Please read the notes above carefully and submit your application through the workshop application form.
(A separate application is required for each workshop.)

After submitting your application, a confirmation email will be automatically sent to the email address entered in the application form. The email is normally delivered within five minutes. Please ensure that your email address is entered correctly. If you do not receive the confirmation email, please contact us through the inquiry form.

Registrations will be accepted on a first-come, first-served basis.

Application Deadline

　The application deadline for each workshop is either:
　　※ The date specified for the workshop, or
　　※ 3:00 PM on the business day preceding the workshop

Please refer to the description of each workshop for detailed deadline information.

Minimum Enrollment Requirement

　A workshop will be held if three or more participants have registered by the application deadline.
　　※ If the application deadline falls on a holiday, the last business day preceding the holiday will be used as the reference date.
　　※ Workshops marked with "※2" in the table below will be held with one or more registered participants.

The current number of registered participants can be checked here.

Schedule

Workshops whose titles are not shown in English will be conducted in Japanese. Please note that English-language questions and discussions may not be supported during these sessions.

日時	講習会タイトル	会場	人数	内容
10/19（月） 13:30-15:30 ※1, ※2	TSUBAME利用法入門編(Linux基礎)(すずかけ台)	すずかけ台図書館2階情報ネットワーク演習室	20	※10/23（金）, 11/04（水）は同じ内容です。 TSUBAMEをはじめてお使いの方向けに、TSUBAMEおよびLinuxについてご紹介し、実際にTSUBAMEにログインして簡単な操作を行います。＜内容＞・TSUBAME4の概要・Linuxの基礎操作(ファイル操作・各種コマンド) ・TSUBAME上でのプログラムの実行方法 ※Open OnDemandを使用される場合は、事前にTSUBAMEパスワードの設定が必要です。 https://www.t4.cii.isct.ac.jp/docs/portal.ja/prepare/#set_password ※ご自分のノートPCを使用される場合は、事前にTSUBAMEポータルからSSH秘密鍵の登録と、ご自分のPCのターミナルソフトウェアでSSHログインの設定が必要です。 https://www.t4.cii.isct.ac.jp/docs/portal.ja/prepare/#ssh_key
10/20（火） 13:30-15:30 ※1, ※2	Introduction to TSUBAME(Linux basics)	Computer room 109 on the 1st floor in South Bldg.6,Ookayama South Area,	20	＊This lecture is conducted in English. ＊Nov 06(Fri) it will have the same content. For those who are using TSUBAME for the first time, we will introduce TSUBAME and Linux, and actually log in to TSUBAME and perform simple operations. ＜Contents＞ - Introduction of TSUBAME4 - Linux Basics(File manipulation, Shell commands) - How to run programs in TSUBAME4 * If you use Open OnDemand, you need to set a TSUBAME password in advance. https://www.t4.cii.isct.ac.jp/docs/portal.en/prepare/#set_password * If you intend to use your own laptop, you must first register your SSH private key via the TSUBAME Portal and configure SSH login settings in your terminal software. https://www.t4.cii.isct.ac.jp/docs/portal.en/prepare/#ssh_key
10/21（水） 13:30-17:00	Amber	大岡山南6号館1階109演習室	10	※実習室のPCを使用 ※テキストの配付あり＜講義内容＞ Jupyter notebookの説明トポロジーおよび座標ファイルの作成・タンパク質の力場の読み込み・アラニン・ジペプチド系の構築・Amberのprmtopとinpcrd入力ファイルの保存分子動力学計算の実行・構造最適化の設定入力および実行・昇温の設定入力および実行・プロダクション工程の入力および実行動力学計算の結果の解析・エネルギー解析・トラジェクトリーのRMSD解析 Amberパラメーターの詳細・一般有機分子パラメーターの調製・電荷分布計算・PDB形式ファイルの入手およびAmber用に修正・たんぱく質と有機分子を含む系の構築シミュレーションの実行
10/23（金） 13:30-15:30 ※1, ※2	TSUBAME利用法入門編(Linux基礎)(大岡山)	大岡山南6号館1階109演習室	20	※10/19（月）, 11/04（水）は同じ内容です。 TSUBAMEをはじめてお使いの方向けに、TSUBAMEおよびLinuxについてご紹介し、実際にTSUBAMEにログインして簡単な操作を行います。＜内容＞・TSUBAME4の概要・Linuxの基礎操作(ファイル操作・各種コマンド) ・TSUBAME上でのプログラムの実行方法 ※Open OnDemandを使用される場合は、事前にTSUBAMEパスワードの設定が必要です。 https://www.t4.cii.isct.ac.jp/docs/portal.ja/prepare/#set_password ※ご自分のノートPCを使用される場合は、事前にTSUBAMEポータルからSSH秘密鍵の登録と、ご自分のPCのターミナルソフトウェアでSSHログインの設定が必要です。 https://www.t4.cii.isct.ac.jp/docs/portal.ja/prepare/#ssh_key
10/27（火） 13:30-17:00	COMSOL	大岡山南6号館1階109演習室	20	※開催の準備のため10/13（火）の15:00までに申し込みください。 ※受講者のノートパソコンを使用（Windows 11）（アプリケーション配布あり）受講者PC動作要件：https://www.comsol.jp/system-requirements ※テキストの電子配付あり。＜講義内容＞初心者を対象に、入門レベルの課題を通じて複数の物理現象を組み合わせたシミュレーションを学習します。 COMSOL Multiphysicsは、電磁場/構造/熱流体/化学反応など物理分野を問わず同じ操作でモデリングが可能です。本講習で基本的な操作方法をご習得いただければ、ご自身のご研究分野の解析にご活用いただけます。シングルフィジックスモデリング 1題 (全体の操作フロー解説/CADインポート機能/パラメータ設定方法) マルチフィジックスモデリング 3～4題 (片方向・双方向の連成解析/3つの物理の連成解析)
11/4（水） 13:30-15:30 ※1, ※2	TSUBAME利用法入門編(Linux基礎)(大岡山)	大岡山南6号館1階211演習室	20	※10/19（月）, 10/23（金）は同じ内容です。 TSUBAMEをはじめてお使いの方向けに、TSUBAMEおよびLinuxについてご紹介し、実際にTSUBAMEにログインして簡単な操作を行います。＜内容＞・TSUBAME4の概要・Linuxの基礎操作(ファイル操作・各種コマンド) ・TSUBAME上でのプログラムの実行方法 ※Open OnDemandを使用される場合は、事前にTSUBAMEパスワードの設定が必要です。 https://www.t4.cii.isct.ac.jp/docs/portal.ja/prepare/#set_password ※ご自分のノートPCを使用される場合は、事前にTSUBAMEポータルからSSH秘密鍵の登録と、ご自分のPCのターミナルソフトウェアでSSHログインの設定が必要です。 https://www.t4.cii.isct.ac.jp/docs/portal.ja/prepare/#ssh_key
11/5（木） 13:30-15:30	Schrodinger	オンライン（ハンズオン）	20	※オンライン開催の準備のため10/29（木）の15:00までに申し込みください。 ※受講者PCにアプリをインストール製品バージョン：Schrodinger Suites 2025-3 動作環境：　Windows：Windows 11 　Mac：macOS 13, 14 ,15 ※ Linuxでも利用可能です。ご希望される方がいらっしゃれば別途ご案内差し上げます。 ※テキストの電子配付あり ※操作体験が不要であれば聴講のみでも可＜講義内容＞・Maestro 11の基本操作: 各種可視化・描画機能、重ね合わせ機能、解析機能の紹介・Protein Preparation WizardによるPDBからのシミュレーション用モデルの準備・2Dリガンドデータベースからドッキング用に最適化された3次元構造データの準備・Glideによるドッキングスタディー・各種ドッキングポーズの解析機能について
11/6（金） 13:30-15:30 ※1, ※2	Introduction to TSUBAME(Linux basics)	Computer room 109 on the 1st floor in South Bldg.6,Ookayama South Area,	20	＊This lecture is conducted in English. ＊Oct 20(Tue) it will have the same content. For those who are using TSUBAME for the first time, we will introduce TSUBAME and Linux, and actually log in to TSUBAME and perform simple operations. ＜Contents＞ - Introduction of TSUBAME4 - Linux Basics(File manipulation, Shell commands) - How to run programs in TSUBAME4 * If you use Open OnDemand, you need to set a TSUBAME password in advance. https://www.t4.cii.isct.ac.jp/docs/portal.en/prepare/#set_password * If you intend to use your own laptop, you must first register your SSH private key via the TSUBAME Portal and configure SSH login settings in your terminal software. https://www.t4.cii.isct.ac.jp/docs/portal.en/prepare/#ssh_key
11/10（火） 13:30-16:45	Gaussian / GaussView	大岡山南6号館1階109演習室	20	※実習室のPCを使用 ※テキストの電子配付あり ※実習あり＜講義内容＞〇GaussView ・GaussView 概要・基本操作　- 分子のモデリング　- 計算条件の設定と計算の実行　- 計算結果の確認・便利な機能〇Gaussian 　・Gaussian 概要・使用するファイル　- ファイル一覧　- 入力ファイル詳細　- 出力ファイル詳細・計算化学の基礎　- 構造最適化（安定状態と遷移状態）　- 溶媒効果・その他の話題　- DFTにおける長距離補正/分散力補正　- よく使うキーワード　- 最新版の情報
11/11（水) 13:30-16:00	Mathematica講習会（初級者向け）	大岡山南6号館1階109演習室	20	※実習室のPCを使用（Mathematicaをインストールしたご自分のPCを使用しても構いません） ※テキストの電子配付あり＜目的＞ Mathematicaは数式を処理したり数値計算を行うだけでなく、画像処理や機械学習などの多くの機能を備えています。基礎から応用事例までを実際に操作することにより、Mathematica の様々な使い方を学ぶことができるハンズオン形式の講座です。 Mathematicaを使った解析例や大規模言語モデル（LLM）との連携についても簡単に紹介します。＜内容＞ □基礎　基本的な使用方法、プログラミングの基礎 □数式処理・数値解析　方程式を解いて解を可視化、微分積分の計算方法、微分方程式を解く方法 □解析例の紹介　・データの入出力　・熱伝導方程式のシミュレーション　・粒子解析　・分類器の生成など ※内容は一部変更になる可能性があります。
11/13（金） 10:00-17:00	Discovery Studio	大岡山南6号館2階109演習室	10	※開催の準備のため10/30（金）の15:00までに申し込みください。 ※受講者のノートパソコンを使用（Windows11 Pro/Ent/Edu）（アプリケーションの配付あり） ※テキストの配付あり。＜講義内容＞各項目では、説明とデモを行い、および時間の許す限りでQ&A 10:00－12:00 General Introduction and Discovery Studio Client（Discovery Studioの基本的な使い方） 13:00－14:20 Protein Molecular Dynamics Simulation(分子動力学計算) 14:30－15:40 Protein-Small molecule Docking(タンパク質―低分子複合体予測) 15:50－17:00 Protein Homology Modeling（タンパク質構造予測） ※受講者側環境での不具合やエラーについての問合せは、講習会内ではお答えできません。
11/17（火） 10:00-17:00	Materials Studio	大岡山南6号館1階109演習室	10	※開催の準備のため11/2（月）の15:00までに申し込みください。 ※受講者のノートパソコンを使用（Windows11 Pro/Ent/Edu）（アプリケーションの配布あり） ※テキストの配付あり。＜講義内容＞各項目では、説明とデモを行い、および時間の許す限りでQ&A 10:00--12:00... Visualizer 12:00--13:00... Lunch 13:00--15:00... Forcite Plus/Amorphous Cell/COMPASS 15:00--15:15... Break 15:15--16:30... DMol3/CASTEP 16:30--17:00... Reflex Plus ※受講者側環境での不具合やエラーについての問合せは、講習会内ではお答えできません。
11/18（水） 13:30-17:00	並列化プログラミング	大岡山南6号館1階109演習室	20	※実習室のPCを使用 ※テキストの配付あり並列化プログラミング初心者の方を対象としています。 - 並列化の基礎 - コンパイラオプションによる最適化 - コンパイルレポート等を用いた最適化手法 - プロファイラを用いた最適化手法 ※Open OnDemandを使用される場合は、事前にTSUBAMEパスワードの設定が必要です。 ※ご自分のノートPCを使用される場合は、TSUBAMEへSSH or OpenOnDemand でログインできること。
11/20（金） 10:00-17:00	ANSYS流体解析	大岡山南6号館1階109演習室	20	※開催の準備のため11/6（金）の15:00までに申し込みください。 ※受講者のノートパソコンを使用 ※アプリケーション配布あり。受講者PC(Windows11 Pro/Ent/Edu)を使用して実習、PC環境が整っていない方は聴講のみ。 ※テキストの電子配付あり。流体解析では、いくつかの演習を通してAnsys Fluent の基本機能の習得を目標とします。また、モデリング上の注意事項、CFD 解析の基本手順などについてもご説明いたします。＜セミナー内容＞ ANSYS Fluentを使った基本的な解析操作 ANSYS Fluent の機能紹介ソルバー設定、物性値、境界条件乱流モデル、伝熱
11/24（火） 10:00-17:00	ABAQUS/CAE入門	大岡山南6号館 1階109演習室	6	※開催の準備のため11/10（火）の15:00までに申し込みください。 ※受講者のノートパソコンを使用（Windows11 Pro/Ent/Edu）(アプリケーション配付あり） ※テキストの配付あり。 Abaqus/CAEはAbaqus専用のプリポストプロセッサです。本コースではAbaqus/CAEの概要とAbaqus/CAEを使用した解析モデルの作成、解析ジョブの投入とモニタ、解析結果の表示までの使用方法について説明いたします。限られた時間での開催となるため、研究用の個別モデルに関する質問への回答ができない場合がございます。あらかじめご了承ください。＊この講習は実習を含みます。＊＊本コースは所要2日間の内容を1日に短縮して実施するダイジェスト版です。
11/25（水） 10:00-17:00	ANSYS構造解析	大岡山南6号館 1階109演習室	20	※開催の準備のため11/11（水）の15:00までに申し込みください。 ※受講者のノートパソコンを使用 ※アプリケーション配布あり。受講者PC(Windows11 Pro/Ent/Edu)を使用して実習、PC環境が整っていない方は聴講のみ。 ※テキストの電子配付あり。構造解析では、様々な外力や内力により構造物の状態を定量的に把握し分析します。本セミナーでは、ANSYS Mechanicalを用いて構造解析を考えていらっしゃる方を対象に、解析設定から結果評価までの操作を体験いただけます。＜セミナー内容＞ ANSYS Workbenchの説明 ANSYS Mechanicalでのプリプロセス（ジオメトリの読み込み、接触設定、メッシュ設定） ANSYS Mechanicalでの解析設定（静的線形解析、固有値解析、伝熱解析）
11/27（金） 10:00-17:00	ANSYS電磁界解析	大岡山南6号館1階109演習室	20	※オンライン開催の準備のため11/13（金）の15:00までに申し込みください。 ※アプリケーション配布あり。受講者PC(Windows11 Pro/Ent/Edu)を使用して実習、PC環境が整っていない方は聴講のみ。 ※テキストの電子配付あり。 ANSYS HFSS / ANSYS Q3D Extractor / ANSYS Maxwell 3D のいずれかを初めて使用するユーザー様向けです。Desktop（ANSYS HFSS / ANSYS Q3D Extractor / ANSYS Maxwell 3D 共通）で使用される基本概念と用語について学習します。基本例題を使ってモデルを作成し、各種設定から解析までの流れを習得します。セミナー内容 ANSYS HFSSの基本例題・解析手法とアダプティブオートメッシュ・設定と解析の流れ解析モデルの作成・ Desktop 画面構成・プロジェクト・基本形状の作成・図形の移動・コピー、演算・モデルインポートとその修正・材料特性の設定・境界条件・解析設定
12/1（火） 10:00-17:00	ABAQUS/Standard & Explicit 入門	大岡山南6号館 1階109演習室	6	※開催の準備のため11/17（火）の15:00までに申し込みください。 ※受講者のノートパソコンを使用（Windows11 Pro/Ent/Edu）(アプリケーション配付あり） ※テキストの配付ありこれから Abaqus/Standard とAbaqus/Explicit を使用して線形問題と非線形問題を解析されるユーザを対象としています。機能の概要，キーワードによる入力データの作成方法、ジョブの実行方法、解析で発生する問題の解決方法，Abaqus/Viewerによる後処理、結果の見方などが説明されます。 Abaqus S&Eセミナーでは、Abaqusに関する基本的な知識・操作経験をお持ちであることを前提としております。ご不安な場合は、CAEセミナーからのご受講がおすすめです。限られた時間での開催となるため、Abaqus/CAEの操作説明や補足、研究用の個別モデルに関する質問への回答ができない場合がございます。あらかじめご了承ください。＊この講習は実習を含みます。＊＊本コースは所要2日間の内容を1日に短縮して実施するダイジェスト版です。
12/2（水） 13:30-16:30	GPUプログラミング	大岡山南6号館1階109演習室	20	※実習室のPCを使用 ※テキストの電子配付あり。タイトル：GPU コンピューティング講習会～CUDA 及び OpenACC による GPU コンピューティング入門概要：本講座は、CUDA または OpenACC によるプログラミングをこれから学びたいという方が対象です。 NVIDIA GPU のアーキテクチャおよび GPU コンピューティングの基礎について概説するとともに、 TSUBAME4.0上で、ハンズオンコードのビルドと実行を体験していただきます。 ※Open OnDemandを使用される場合は、事前にTSUBAMEパスワードの設定が必要です。 ※ご自分のノートPCを使用される場合は、TSUBAMEへSSH or OpenOnDemand でログインできること。

※1 Since the content is the same, you only need to attend one of the scheduled sessions.